Quimio-informática
Código
10716
Unidade Orgânica
Faculdade de Ciências e Tecnologia
Departamento
Departamento de Química
Créditos
3.0
Professor responsável
João Montargil Aires de Sousa
Horas semanais
2
Total de horas
28
Língua de ensino
Português
Objectivos
Aprender as principais estratégias para a representação computacional de estruturas moleculares e reações químicas. Aprender a representar aspetos específicos da estrutura molecular por descritores moleculares. Aprender os fundamentos da metodologia QSAR/QSPR e a sua implementação com regressões lineares, árvores de decisão e redes neuronais.
Pré-requisitos
Conhecimentos básicos de química orgânica. Conhecimentos básicos de informática (trabalho no ambiente Windows ou Linux, utilização de folhas de cálculo, utilização de web browsers para acesso a informação na Internet).
Conteúdo
1. Representação de estruturas moleculares: notações lineares, grafos moleculares, tabela de conetividade, chaves estruturais, hashed fingerprints e hash codes.
2. Representação de reações químicas.
3. Descritores moleculares.
4. Métodos para previsão de propriedades (QSPR/QSAR): regressões lineares, árvores de decisão e redes neuronais.
Bibliografia
1. Chemoinformatics - a Textbook, Gasteiger, J. Engel, T., Eds.; Wiley-VCH: Weinheim, 2003.
2. Leach, A. R.; Gillet, V. J. An Introduction to Chemoinformatics, 2ª ed.; Springer: Dordrecht, 2007.
3. Pequenos textos auxiliares, tutoriais, problemas resolvidos disponibilizados no sistema Moodle.
Método de ensino
A disciplina utiliza a metodologia de Aprendizagem Baseada em Equipas (Team-Based Learning, TBL, http://www.teambasedlearning.org).
O curso é organizado em 4 blocos de matéria. Antes de cada bloco, o professor indica aos alunos a matéria a estudar, o material de estudo e os objetivos a alcançar. Antes da primeira aula de um bloco, cada aluno resolve individualmente um Teste para Garantir a Preparação (TGPi). As aulas de um bloco começam com a resolução em equipa do mesmo teste que foi resolvido individualmente – TGPe. Após o TGPe, o Professor resolve o teste na aula, discute dúvidas e faz uma “mini aula teórica” onde reforça os pontos mais difíceis do bloco.
Nas outras aulas do bloco, as equipas realizam tarefas de aplicação da matéria, progressivamente mais exigentes.
Método de avaliação
Atividades das aulas (60%) e exame final (40%). Notas mínimas: 8 de aulas e 10 no exame.
Nota das atividades das aulas=média TGP individuais (50%) e resultados da equipa (25% TGPs, 75% atividades de aplicação). Nota ajustada com avaliação dos colegas: nota da equipa x pontos dados pelos colegas/100.
A nota das atividades das aulas não é passível de melhoria no mesmo ano. A nota do exame pode ser melhorada num segundo exame.