Epidemiologia Molecular
Código
10779
Unidade Orgânica
Faculdade de Ciências e Tecnologia
Departamento
Departamento de Ciências da Vida
Créditos
3.0
Professor responsável
Isabel Maria dos Santos Leitão Couto, Paula Maria Theriaga Mendes Bernardo Gonçalves
Horas semanais
4
Total de horas
30
Língua de ensino
Inglês
Objectivos
A Unidade Curricular “Epidemiologia Molecular” tem como principal objectivo dar a conhecer os princípios da epidemiologia molecular, os fundamentos conceptuais e metodológicos em que se baseia e principais aplicações.
Ao completar esta Unidade Curricular, os alunos deverão conseguir:
- Definir epidemiologia molecular.
- Enumerar a utilidade da vigilância epidemiológica.
- Definir epidemia, endemia e pandemia, dando exemplos.
- Definir prevalência, incidência cumulativa e taxa de incidência.
- Explicar sucintamente a utilidade dos biomarcadores e sua validação.
- Calcular e interpretar sensibilidade, especificidade, valor preditivo positivo, valor preditivo negativo, prevalência aparente e prevalência real.
- Distinguir e descrever os diferentes tipos de estudo em epidemiologia molecular.
- Fazer a distinção entre isolado, estirpe e espécie.
- Compreender os fundamentos dos principais métodos utilizados em epidemiologia molecular e sua aplicabilidade a diferentes situações/organismos.
- Conhecer e aplicar critérios de classificação dos principais métodos moleculares de tipagem.
- Interpretar árvores filogenéticas e diferentes padrões de géis de HMA (“heteroduplex mobility assay”) aplicados à genotipagem do vírus da imunodeficiência humana (VIH): vantagens e limitações de cada método.
Pré-requisitos
não tem
Conteúdo
1. Apresentação do programa da UC, objectivos e avaliação.
- Tópicos das aulas teóricas:
2. Introdução a alguns conceitos básicos de epidemiologia. Testes de diagnóstico.
3. Métodos utilizados em epidemiologia molecular.
4. Tipos de estudos em Epidemiologia Molecular: geográficos, de transmissão e de patogenicidade.
5. Métodos moleculares de tipificação de bactérias.
6. Epidemiologia molecular do vírus da imunodeficiência humana (VIH).
- Conteúdos das aulas teórico-práticas:
7. Biomarcadores e testes de diagnóstico – exercícios.
8. Tipos de estudos em Epidemiologia Molecular: geográficos, de transmissão e de patogenicidade.
9. Epidemiologia molecular de parasitas: uso de microssatélites e problemática da diploidia.
10. Métodos moleculares de tipificação de bactérias (exemplos).
11. Epidemiologia molecular do vírus da imunodeficiência humana (VIH): genotipagem por inferência filogenética e “heteroduplex mobility assay” (HMA).
Bibliografia
- Kenrad E., Carolyn M. (2007). Infectious Disease Epidemiology: Theory and Practice. Jones and Barlett Publishers. p. 1207. ISBN-13: 978-0-7637-2879-3, ISBN-10: 0-7637-2879-9.
- Schulte, Paul A.; Perera, Frederica P. (1993). Molecular Epidemiology: Principles and Practice. Academic Press. p. 588. ISBN 0-12-632346-1.
- Bibliografia adicional a indicar por cada docente.
Método de ensino
Aulas teóricas de 1,5 h, utilizando apresentações de slides em Power-Point.
As aulas-teórico-práticas de 2,5 h, pretendem ser interactivas e consistem na análise e interpretação de resultados experimentais,com recurso pontual a bases de dados on-line.