Química Computacional Aplicada
Código
7211
Unidade Orgânica
Faculdade de Ciências e Tecnologia
Departamento
Departamento de Química
Créditos
6.0
Professor responsável
António Gil de Oliveira Santos, João Montargil Aires de Sousa
Horas semanais
3
Total de horas
5
Língua de ensino
Português
Objectivos
Os alunos deverão poder modelar sistemas orgânicos complexos e compreender a sua reactividade, com especial realce na modelação de sistemas assimétricos. Integração de conhecimentos com as disciplinas de Química Orgânica e Análise Estrutural. Familiarização com estratégias para o estabelecimento de relações estrutura-actividade (QSAR). Conhecimentos teóricos e práticos sobre a utilização de ferramentas computacionais para a descoberta e desenvolvimento de fármacos.
Pré-requisitos
Conhecimentos de Química Orgânica e Química Física. Conhecimentos básicos de Matemática.
Conteúdo
Modelação Molecular: 1. A Modelação Molecular Computacional como ferramenta em Química Orgânica. Software de edição molecular e software de cálculo quântico. 2. Abordagens teóricas mais comuns para a racionalização da reatividade química. 3. Cálculo de sistemas em solução, estados excitados e estados de transição. Modos normais de vibração e correções termodinâmicas. 4. Modelação de sistemas assimétricos.
Quimioinformática: 5. Relações quantitativas estrutura-actividade (QSAR) e estrutura-propriedade (QSPR). 6. Design de sínteses orgânicas. 7. Métodos computacionais (nomeadamente docking) no processo de descoberta de drogas.
Bibliografia
1. A Guide to Molecular Mechanisms and Quantum Chemical Calculations, Warren. J. Hehre, Wavefunction, Inc., 2003.
2. Molecular Modelling, Principles and Applications, Andrew R. Leach, 2nd Ed., Pearson, Prentice Hall, 2001.
3. Introduction to Computational Chemistry, Frank Jensen, John Wiley and Sons, 1999.
4. Chemoinformatics - A Textbook, eds. Johnann Gasteiger and Thomas Engel, Wiley-VCH, 2003.
5. Handbook of Chemoinformatics, ed. Johnann Gasteiger, Wiley-VCH, 2003.
Método de ensino
As aulas são lecionadas com recurso a modernas tecnologias de multimedia. Os alunos terão acesso à utilização de computadores pessoais equipados com software de modelação e visualização 3D, bem como aos clusters de computadores existentes no Departamento.
Método de avaliação
ESTA É UMA UNIDADE CURRICULAR DE SEMINÁRIO.
Os alunos serão avaliados através de avaliação contínua durante as aulas (60%), bem como pela preparação, apresentação e discussão dum seminário (em cada metade da disciplina) sobre um tema a escolher, na área de Química Computacional (40%).
A avaliação contínua na parte de Modelação Molecular é obtida através da prestação do aluno durante as aulas (20%) e pela apresentação, em grupo, de trabalhos diversos resolvidos em casa (máximo de 4 trabalhos - 80%).
A avaliação contínua na parte de Quimio-informática resulta das notas dos Testes para Garantir a Preparação individuais (50%) e da média das notas obtidas nas atividades de equipa modulada pela avaliação inter-pares (50%).
De acordo com o regulamento de avaliação as notas de seminário e de avaliação contínua desta Unidade Curricular não podem ser melhoradas no mesmo ano letivo.