Química Computacional Aplicada
Código
7211
Unidade Orgânica
Faculdade de Ciências e Tecnologia
Departamento
Departamento de Química
Créditos
6.0
Professor responsável
António Gil de Oliveira Santos, João Montargil Aires de Sousa
Horas semanais
3
Total de horas
50
Língua de ensino
Português
Objectivos
Os alunos deverão poder modelar sistemas orgânicos complexos e compreender a sua reactividade, com especial realce na modelação de sistemas assimétricos. Integração de conhecimentos com as disciplinas de Química Orgânica e Análise Estrutural. Familiarização com estratégias para o estabelecimento de relações estrutura-actividade (QSAR). Conhecimentos teóricos e práticos sobre a utilização de ferramentas computacionais para a descoberta e desenvolvimento de fármacos.
Pré-requisitos
Conhecimentos de Química Orgânica e Química Física. Conhecimentos básicos de Matemática.
Conteúdo
1. A Modelação Molecular Computacional como ferramenta em Química Orgânica.
2. Relações quantitativas estrutura-atividade (QSAR) e estrutura-propriedade (QSPR).
3. Design de sínteses orgânicas.
4. Software de edição molecular. Mecânica molecular. Docking.
5. O papel da Química Computacional no processo de descoberta de drogas.
6. Software de cálculo quântico.
7. Abordagens teóricas mais comuns para a racionalização da reatividade química, com recurso a mecânica quântica.
8. Cálculo de sistemas em solução, estados excitados e estados de transição. Modos normais de vibração e correções termodinâmicas.
9. Modelação de sistemas assimétricos.
Bibliografia
1. A Guide to Molecular Mechanisms and Quantum Chemical Calculations, Warren. J. Hehre, Wavefunction, Inc., 2003.
2. Molecular Modelling, Principles and Applications, Andrew R. Leach, 2nd Ed., Pearson, Prentice Hall, 2001.
3. Introduction to Computational Chemistry, Frank Jensen, John Wiley and Sons, 1999.
4. Chemoinformatics - A Textbook, eds. Johnann Gasteiger and Thomas Engel, Wiley-VCH, 2003.
5. Handbook of Chemoinformatics, ed. Johnann Gasteiger, Wiley-VCH, 2003.
Método de ensino
As aulas são lecionadas com recurso a modernas tecnologias de multimedia. Os alunos terão acesso à utilização de computadores pessoais equipados com software de modelação e visualização 3D, bem como aos clusters de computadores existentes no Departamento.
Método de avaliação
Avaliação global da Unidade Curricular:
Os alunos serão avaliados através da sua prestação durante as aulas (15%), onde se inclui a discussão de diversos trabalhos individuais resolvidos em casa, e pela resolução de três testes individuais (85%). O primeiro e segundo testes, de carácter teórico, terão o peso de 30% e 35% da nota global, respectivamente, enquanto que o terceiro, de carácter prático, terá o peso de 20% da nota global. Só poderão ser aprovados à Unidade Curricular, os alunos que obtenham pelo menos 9.50 valores na nota global.
Frequência:
Os alunos que não tenham obtido frequência em anos anteriores, só obterão frequência à Unidade Curricular se frequentarem pelo menos 2/3 das aulas do semestre.
Exame de Recurso:
Os alunos que, tendo obtido frequência à Unidade Curricular, não obtenham nota igual ou superior a 9.50 valores na nota global, terão acesso a uma única época de exame - RECURSO. O exame de recurso incide sobre toda a matéria. A nota do exame de recurso terá o peso de 85% na nota global de recurso, sendo a restante fracção obtida da prestação durante as aulas (15%). O exame de recurso terá uma componente teórica (65%) e uma componente prática (20%). Só serão aprovados os alunos que obtenham pelo menos 9.50 valores na nota global de recurso.