Microbiologia Molecular
Código
9512008
Unidade Orgânica
Instituto de Higiene e Medicina Tropical
Créditos
6
Professor responsável
Isabel Couto
Horas semanais
T: Aulas teóricas: 6,75 Horas / semana (Total de 27 Horas, distribuídas por 4 semanas) OT: Orientação tutorial: 6 Horas / semana (Total de 24 Horas, distribuídas por 4 semanas) PL: Aulas práticas e laboratoriais: 3,75 Horas / semana (Total de 15 Horas, distribuídas por 4 semanas) Nota: cálculos feitos considerando um total de 4 semanas de aulas, com a seguinte distribuição T-27h; TP-0h; PL-15h; OT-24h (4x 6h de 4ª feira?); O-0h.
Língua de ensino
Português
Objectivos
1. Compreender os fundamentos dos métodos moleculares de diagnóstico; suas vantagens e limitações. 2. Compreender e diferenciar os conceitos de identificação versus tipificação. 3. Interpretar a aplicação de métodos moleculares à marcha geral de diagnóstico microbiológico e sua validação. 4. Reconhecer a diversidade dos testes rápidos de diagnóstico e os processos envolvidos no seu desenvolvimento e produção; compreender as suas condições de utilização e vantagens, particularmente no contexto das doenças tropicais e do diagnóstico descentralizado (point-of-care). 5. Compreender a alteração no padrão das infecções fúngicas e associar à necessidade de implementação de um rápido diagnóstico. Saber descrever as principais estratégias de detecção molecular de fungos responsáveis por infecções oportunistas 6. Compreender as diferentes fases do ciclo replicativo viral. Descrever as interacções moleculares estabelecidas, durante o ciclo replicativo viral, por vírus de diferentes famílias com as células animais. Reconhecer os fundamentos moleculares das principais abordagens para a prevenção e a terapêutica das infecções de origem viral. 7. Reconhecer a importância das técnicas de biologia molecular no diagnóstico laboratorial de infecções bacterianas, fúngicas e virais. 8. Analisar criticamente exemplos de aplicações da microbiologia molecular ao diagnóstico de infecções.
Pré-requisitos
Não se aplica
Conteúdo
Componente teórica: 1. Hibridação de ácidos nucleicos. 2. Amplificação de ácidos nucleicos. 3. Novas tecnologias (biossensores, microarrays, nanobiotecnologia) . 4. Métodos moleculares de tipificação. 5. Aplicações de métodos moleculares à marcha geral de diagnóstico microbiológico e sua validação. 6. Aplicação de técnicas moleculares para a detecção de fungos em amostras clínicas. Diagnóstico molecular da criptococose, candidose, aspergilose e tinhas do couro cabeludo. 7. Entrada dos vírus na célula hospedeira. Estratégias replicativas dos vírus com genoma de DNA, de RNA de cadeia simples e de cadeia dupla. Mecanismos de tradução nas células infectadas. Morfogénese dos viriões e saída da célula.Prevenção e terapêutica das doenças de origem viral: vacinas e agentes anti-virais. Componente prática: A: Aplicação de um protocolo de PCR e hibridação reversa para detecção de DNA de Mycobacterium tuberculosis em amostras respiratórias. B: Utilização de PCR-multiplex e PCR em tempo-real para a pesquisa de DNA de Treponema pallidum a partir de uma amostra de exsudado de úlcera genital de doente com suspeita de sífilis primária. C: Extração de DNA de amostras de fungos por diferentes protocolos e identificação ao nível da espécie. D: Extracção e análise de RNA do vírus da hepatite C (HCV) a partir de uma amostra de plasma.
Bibliografia
- Forbes, BA, Sahm, DF, Weissfeld, AS. (2007) Bailey and Scott's Diagnostic Microbiology. Elsevier, 12ª Ed. - Larry Snyder and Wendy Champness (2007). Molecular Genetics of Bacteria. ASM Press. - William D. Stansfield, Jaime S. Colomé, Raúl J. Cano (1998). Biologia Molecular e Celular. McGraw-Hill, 2ª Ed. - Flint SJ, Enquist LW, Racaniello VR, Skalka AM (2009). Principles of Virology. ASM Press, Washington, DC, 3ª Ed. (2 vols.). - Strauss JH, Strauss EG (2008). Viruses and Human Disease. Elsevier Academic Press, Burlington, MA, 2ª Ed.
Método de ensino
As horas de contacto totais (42 hrs.) serão distribuídas por quinze aulas teóricas (27 hrs.) e sete aulas de prática laboratorial (15 hrs.). As aulas teóricas serão baseadas na apresentação de diapositivos. As aulas práticas ilustrarão a aplicação de diversas metodologias à monitorização/caracterização de infecções bacterianas, fúngicas ou virais.
Método de avaliação
Os alunos com 2/3 de frequência das aulas, serão avaliados através de exame escrito com perguntas de escolha múltipla, incidindo sobre os conteúdos das aulas teóricas e práticas (escala de classificação: 0 a 20 valores). Serão aprovados os alunos com classificação igual ou superior a 9,5 valores neste exame.