Génomica e Proteómica aplicadas a Doenças Infecciosas
Código
9512026
Unidade Orgânica
Instituto de Higiene e Medicina Tropical
Créditos
2
Professor responsável
João Rodrigues
Horas semanais
T: Aulas teóricas: Horas / semana (Total de Horas, distribuídas por semanas) OT: Orientação tutorial: Horas / semana (Total de Horas, distribuídas por semanas) 8 T + 10 TP + 4 OT
Língua de ensino
Português
Objectivos
- Melhorar as competências na utilização de ferramentas pós-genómicas (obj. Geral); - Compreender o conjunto de ferramentas disponíveis e sua aplicação; - Compreender, distinguir e avaliar de forma critica os benefícios específicos de cada tecnologia apresentada e sua aplicabilidade no sistema a estudar; - Desenvolver a capacidade de analisar dados obtidos e aplicar na resolução de casos práticos; - Desenvolver a capacidade de planificar experiências, modificar e integrar com outras metodologias de uso comum em doenças infecciosas;
Pré-requisitos
Não se aplica
Conteúdo
- Introdução às técnicas para sequenciação automatizada de fragmentos de DNA e genomas completos; - Genómica Funcional, DNA Microarrays e RNA Sequencing; - Preparação de amostras em Proteómica; Separação de proteínas e péptidos; - Espectrometria de Massa para identificação de péptidos/proteínas e modificações pós-traducionais; - Proteómica Quantitativa e Identificação de interacções entre proteínas; - Metodologias para expressão e purificação de proteínas recombinantes; - Exemplos da aplicação de genómica e proteómica ao estudo de doenças infecciosas.
Bibliografia
- Arthur Lesk, Introduction to Genomics, 2nd ed. (2012) OUP. - Josip Lovric, Introducing Proteomics: From Concepts to Sample Separation, Mass Spectrometry and Data Analysis (2011) Wiley-Blackwell. - Arthur Lesk, Introduction to Protein Science, 2nd ed. (2010) OUP. - Artigos recentes de particular relevância a providenciar pelos docentes.
Método de ensino
- Exposição de conteúdos em formato de lição/conferência; - Apresentação e discussão de “case-studies”; - Sessões teórico-práticas com resolução de problemas
Método de avaliação
- Avaliação de trabalho escrito (preparação de um projecto de investigação) em grupo; - Avaliação de desempenho do grupo na defesa do seu projecto via apresentação oral e discussão com docentes e colegas; - Avaliação pelos colegas “peers”; - Teste de escolha múltipla individual.