Genómica e Evolução Molecular
Código
10717
Unidade Orgânica
Faculdade de Ciências e Tecnologia
Departamento
Departamento de Ciências da Vida
Créditos
3.0
Professor responsável
Ana Rita Fialho Grosso, José Paulo Nunes de Sousa Sampaio
Horas semanais
4
Total de horas
38
Língua de ensino
Português
Objectivos
Compreender os mecanismos básicos da evolução molecular. Conhecer os aspectos essenciais relacionados com o arquivo e obtenção, em bases de dados públicas, de sequências nucleotídicas. Conhecer os fundamentos das novas tecnologias de sequenciação de genomas e as etapas básicas de montagem e análise de dados de genomas completos sob diferentes perspectivas - genómica populacional, genómica comparativa e genómica funcional.
Pré-requisitos
Conhecimentos básicos de Genética Molecular e de Evolução.
Conteúdo
Tópico 1
- Evolução biológica e evolução molecular.
- Aspectos básicos da pesquisa e tratamento de sequências.
Tópico 2
- Evolução de genomas: detecção de transferência horizontal.
- Construção de filogenias moleculares
Tópico 3
- Genómica Molecular e Funcional: genes, expressão génica e função.
- Caracterização de genes: coordenadas genómicas, transcritos, proteínas, genómica comparativa, função, variação genética.
Tópico 4
- Genómica Molecular e Funcional: tecnologias de sequenciação em larga escala.
- Pesquisa e interpretação de dados de transcriptoma.
Tópico 5
- Genómica na Biomedicina
- Genómica do cancro: mutações, alterações cromossómicas, transcritos, proteínas, impacto clinico.
Tópico 6
- Genómica: dados, informação, conhecimento.
- Conceitos básicos na integração de dados, extração de informação e apresentação de resultados.
Bibliografia
Vandamme, AM. 2009. Basic concepts of molecular evolution. In “The Phylogenetic Handbook”, Cambridge Univ Press
Descent with modification (Reading the story of DNA, L Bromham, 2008)
Método de avaliação
A frequência às aulas é fortemente encorajada e obrigatória no caso das aulas teórico-práticas. A obtenção de frequência à Unidade Curricular é condição necessária para obter aprovação, ou seja, o número de faltas às aulas teórico-práticas não pode exceder 1/3 do número total de aulas teórico-práticas. A avaliação consiste na realização de um teste e um trabalho de grupo, contribuindo respectivamente para 60% e 40% da nota final. Para aprovação a nota final mínima é 10.
O teste é realizado individualmente, sem consulta e tem a duração de 45 min. Para aprovação a nota do teste minima é 9,5.
O trabalho de grupo consiste num projecto de integração de dados e informação de forma a gerar novo conhecimento, cujo conteúdo deverá ser apresentado na forma de relatório.