Bioinformática em Biomedicina
Código
10776
Unidade Orgânica
Faculdade de Ciências e Tecnologia
Departamento
Departamento de Ciências da Vida
Créditos
6.0
Professor responsável
Ana Rita Fialho Grosso, João Manuel Gonçalves Couceiro Feio de Almeida
Horas semanais
4
Total de horas
91
Língua de ensino
Português
Objectivos
1. Compreender os conceitos essenciais do desenho experimental, tratamento de dados e interpretação de resultados.
2. Adquirir conhecimentos teóricos e práticos na utilização de ferramentas bioinformáticas baseadas em R.
3. Conhecer as potencialidades da bioinformática na área da biomedicina.
Pré-requisitos
Conhecimentos básicos de Genética Molecular e de Estatística.
Conteúdo
Tópicos
1. Desenho Experimental
2. Análise Descritiva e Exploratória de dados
3. Inferência Estatística 1: comparação de médias e medianas
4. Inferência Estatística 2: Análise de variância
5. Inferência Estatística 3: Análise de dados
6. Análise de dados de larga-escala
7. Associação entre variáveis
8. Análise Exploratória Multivariada
9. Identificação de alterações do transcritoma
10. Anotação e Análise Funcional
11. Análise de sobrevivência
Bibliografia
Método de ensino
As aulas teóricas clássicas de tipo expositivo são em número reduzido. O estudo em autonomia é fortemente encorajado e determinante para a aprovação. Privilegiam-se as sessões de discussão após o estudo em autonomia sendo a participação activa dos alunos monitorizada e avaliada. Nas sessões práticas são discutidos e resolvidos exercícios de aplicação dos conceitos abordados anteriormente em sessões “hands-on” com computador.
Método de avaliação
A frequência às aulas é fortemente encorajada e obrigatória no caso das aulas práticas. A obtenção de frequência à Unidade Curricular é condição necessária para obter aprovação, ou seja, o número de faltas às aulas práticas não pode exceder 1/3 do número total de aulas teórico-práticas. A avaliação consiste na realização de um teste e dois trabalhos de grupo, contribuindo respectivamente para 40% (teste) e 30%+30% (cada trabalho) da nota final. É obrigatória a execução dos 3 elementos de avaliação, em que cada qual deverá ter uma nota mínima de 9.
O teste é realizado individualmente, sem consulta e tem a duração de 1 hora.
Os trabalhos de grupo consistem em projetos de análise de dados, interpretação e integração dos resultados de forma a responder a uma pergunta biológica e subsequente preparação de um artigo cientifico.